Difícil decisión. Personalmente siempre he encontrado a Qgis más amigable con el usuario y a gvSig más difícil de utilizar. Sin embargo el hecho de que la documentación de gvSig sea en español le da algo de ventaja. Probablemente por la misma razón Qgis es el más utilizado en organismos internacionales, mientras que gvSig es el más utilizado en las administraciones españolas.

No parece fácil decidir:

• http://www.miscelaneanatural.org/informatica/sig/la-trampa-del-java-o-por-que-gvsig-no-es-realmente-un-sig-libre
• http://gis.stackexchange.com/questions/13509/qgis-and-gvsig-comparison
• http://mappinggis.com/2013/05/arcgis-gvsig-o-quantum-gis-no-elijas/

Para instalar Qgis:

http://garmendia.blogs.upv.es/instalar-qgis/

Para instalar gvSig:

http://garmendia.blogs.upv.es/instalar-gvsig/