El purín de ortigas no mejora la cosecha

Este año hemos publicado un artículo en PeerJ sobre el purín de ortigas (Urtica dioica). El resultado principal del artículo es que el tratamiento con purín de ortigas no funciona para mejorar la cosecha, al menos en patatas en los suelos de huerta de Valencia. Si algún lector ha realizado algún experimento similar, tanto si le sale que funciona, como si no, por favor dejar el enlace en comentarios.

En contra de lo que mucha gente dice, no ha sido difícil publicar un «resultado negativo». Supongo que tiene que ver con que el diseño experimental esté bien hecho y el resultado sea claro.

El resultado es importante, ya que el tratamiento con purín de ortigas es uno de los tratamientos más utilizados en agricultura ecológica y sin embargo no existía ninguna publicación en la que se evaluase su efecto de forma objetiva.

Para evitar sesgos hemos utilizado un sistema de doble ciego, como se utiliza en medicina. De esta forma ni el agricultor, ni yo mismo mientras realizaba los análisis sabía qué producto era cual. Es decir, el agricultor no podía cuidar más a unas plantas que a otras o a la hora de medir la cosecha no se sabía de qué tratamiento era cada medida. Los códigos utilizados se desvelaron al final. En realidad tampoco hubiese sido necesario, dado que al final no había diferencias significativas entre tratamientos.

 

Diseño experimental en 6 bloques. en cada bloque se han realizado los 6 tratamientos.

 

Los tratamientos que hemos comparado son:

  • Purín de ortigas comercial, a la dosis recomendada por el fabricante.
  • Purín de ortigas comercial, a la mitad de la dosis recomendada por el fabricante.
  • Purín de ortigas comercial, al doble de la dosis recomendada por el fabricante.
  • Purín de ortigas junto con purín de cola de caballo (Equisetum arvense) ambos a la dosis recomendada.
  • Control positivo, con tratamiento de abono foliar convencional.
  • Control negativo, con agua, en la misma cantidad y fechas que los anteriores.

 

Efecto de los tratamientos sobre la cosecha (kg/m) con todos los datos (102 grados de libertad). Los tratamientos son: (A) Purín de ortiga a dosis recomendada (RD); (B) Purín de ortiga a 1/2 RD; (C) Purín de ortiga 2 RD; (D) Purín de Urtica + Equisetum; (E) Abono foliar convencional; (F) control con agua. HSD = 0.6554 kg/m. Las columnas con la misma letra no difieren significativamente en p ≤ 0.05 (HSD).

 

El único efecto que se vio del purín es una pequeña tendencia (no significativa) a mejorar el aspecto de la planta. Pero sin afectar a la cosecha ni a la cantidad de plagas. Es curioso que el tratamiento con abono  foliar convencional tampoco sirva de nada. Probablemente tampoco sea efectivo y sea otra forma de tirar dinero (en este caso para agricultores convencionales).

Un efecto que no esperábamos es un efecto del riego. Debido a la inclinación de la parcela, en la zona más baja, el agua se acumulaba más y la cosecha en esa zona ha sido mayor. Por suerte el diseño en bloques ha servido para poder lidiar con ese efecto. El artículo se puede utilizar como ejemplo de cómo analizar el efecto de una variable anulando (utilizando los residuos) el efecto de otra.

 

Conclusión: Para cultivar patatas en Valencia es mejor no gastar dinero en tratamientos que no funcionan. Si se quiere gastar en algo, mejor aumentar lo que se pueda el riego.

 

Para leer el artículo completo, aquí.

Para obtener el código de R y los datos originales con el que se han realizado los análisis, aquí.

 

Mediación y moderación. Dos formas distintas de interacción.

La mediación y la moderación son dos formas diferentes de interacción de las que no es fácil encontrar buenos ejemplos en la bibliografía. Aprovechando que el tema ha salido en clase, aprovecho para aclararlo por aquí.

Una variable mediadora intenta explicar el mecanismo por el que ocurre el efecto, mientras que una variable moderadora cambia el efecto que tiene la variable independiente sobre la dependiente. Como el post me  está quedando largo, pongo un índice. Primero cuento la moderación y pongo un ejemplo con las especies de iris. Después para sólo una especie, hago un ejemplo de mediación.

Moderación

La moderación  es lo que normalmente se entiende por «interacción» en Estadística. Es cuando una variable moderadora (Z) cambia el efecto que la variable independiente (X) tiene sobre la variable dependiente (Y).

Es decir, suponiendo que X e Y están relacionadas linearmente,

Y = a + b X

la variable moderadora puede cambiar esto ya que b depende de Z.

Y = a +b X + c Z + d XZ

Ejemplo de moderación con R e iris

Lo primero es comprobar el efecto directo de la variable dependiente (Sepal.Length) sobre la variable independiente (Petal.Length).

### direct relationship
lmC <- lm(Petal.Length ~ Sepal.Length, data = iris)
summary(lmC)

### Plot
plot(Petal.Length ~ Sepal.Length, data = iris)
abline(lmC)

Coefficients:
             Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) 
(Intercept) -7.10144 0.50666 -14.02 <2e-16 ***
Sepal.Length 1.85843 0.08586  21.65 <2e-16 ***

Residual standard error: 0.8678 on 148 degrees of freedom
Multiple R-squared: 0.76, Adjusted R-squared: 0.7583 
F-statistic: 468.6 on 1 and 148 DF, p-value: < 2.2e-16

 

Se observa una fuerte relación (luego veremos que mal entendida) entre la longitud de los sépalos y de los pétalos. Lo siguiente es comprobar el efecto moderador de la variable Species.

### Moderation effect
lmZ <- lm(Petal.Length ~ Sepal.Length +
as.numeric(Species) +
I(Sepal.Length * as.numeric(Species)),
data = iris)
summary(lmZ)

Coefficients:
                                      Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
(Intercept)                           -6.91282    0.76764  -9.005 1.08e-15 ***
Sepal.Length                           1.36959    0.14659   9.343  < 2e-16 ***
as.numeric(Species)                    3.12118    0.33548   9.304  < 2e-16 ***
I(Sepal.Length * as.numeric(Species)) -0.29266    0.05889  -4.970 1.85e-06 ***

Residual standard error: 0.3915 on 146 degrees of freedom
Multiple R-squared:  0.9518,	Adjusted R-squared:  0.9508 
F-statistic: 961.1 on 3 and 146 DF,  p-value: < 2.2e-16

 

Se observa que hay interacción y que todas las variables analizadas tienen un efecto significativo por separado y por su interacción. También se puede ver que el modelo es mejor que el anterior, ya que R2 ha aumentado bastante.

Los resultados se pueden representar utilizando base R o con ggplot.

Base R plot

### Partial linear models
set <- subset(iris, Species == "setosa")
ver <- subset(iris, Species == "versicolor")
vir <- subset(iris, Species == "virginica")

lmset <- lm(Petal.Length ~ Sepal.Length, data = set)
lmver <- lm(Petal.Length ~ Sepal.Length, data = ver)
lmvir <- lm(Petal.Length ~ Sepal.Length, data = vir)

summary(lmset)
summary(lmver)
summary(lmvir)

### Plot
plot(Petal.Length ~ Sepal.Length, col = as.numeric(Species), data = iris)
abline(lmset, col = 1)
abline(lmver, col = 2)
abline(lmvir, col = 3)

ggplot

library(ggplot2)
ggplot(data = iris, aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length, col = Species,
shape = Species)) +
# geom_point(size = 3) +
geom_jitter(size = 2) +
geom_smooth(method = 'lm',formula = y ~ x) +
theme_bw()

 

Mediación

Para que exista mediación es necesario que:

  • Haya un efecto C, efecto directo entre la variable independiente (X) y la dependiente (Y).
  • Haya un efecto A entre la variable independiente y la variable mediadora (M).
  • Haya un efecto B entre la variable mediadora y la variable dependiente.

En ese caso la duda es cuanto efecto C queda como C’ (efecto residual) si tenemos en cuenta el efecto que pasa a través de la variable mediadora.

El efecto C lo podemos estimar en un modelo lineal a partir de la pendiente y la probabilidad (p) de que sea al azar. Para decir que hay un efecto p tiene que ser menor de 0.05, que va a ser nuestro nivel de significación.

Modelo 1: Y = a1 + C X , p1 < 0.05

Modelo 2: M = a2 + A X, p2 < 0.05

Modelo 3: Y = a3 + B M, p3 < 0.05

Donde C, A y B representan las pendientes de la recta, cuanto mayor sea, mayor es el efecto de X en Y, de X en M o de M en Y respectivamente.

Una vez que los tres modelos anteriores son significativos (p < 0.05), lo que nos queda por saber es cuando del efecto inicial de X en Y se mantiene al tener en cuente el efecto de M en Y.

Modelo 4: Y = a4 + C’ X + B M,       pc’ = ??

donde se pueden dar dos opciones:

  • que pc’ < 0.05, moderación parcial.
  • que pc’ ≥ 0.05, moderación total.

En ambos casos la pendiente C’ debería ser menor que la pendiente C. En el primer caso, la moderación parcial significa que parte del efecto de X sobre Y, pasa a través de M, pero no todo. En el segundo caso, la moderación total, es que todo el efecto pasa a través de la variable moderadora.

Ejemplo de moderación con R e iris.

Para el ejemplo voy a utilizar los datos «iris» de longitud y anchura de pétalos y sépalos en Iris versicolor. Ya hemos visto en el ejemplo de mediación, que no tendría sentido hacerlo para las tres especies juntas.

Voy a explorar la posibilidad de mediación de la longitud de los pétalos entre la longitud de los sépalos y la anchura de los pétalos. Es decir, viendo si el efecto que tiene la longitud de los sépalos en la anchura de los pétalos es directo o si pasa por la longitud de los pétalos.

Una cosa importante es no confundir la moderación estadística con la moderación causal. El que algo sea significativo estadísticamente no es suficiente para considerar que hay una relación causa – efecto (también pasa con la mediación, la correlación y cualquier otro test estadístico).

Modelo 1

### Iris versicolor
ver <- subset(iris, Species == "versicolor")

### Plot
plot(Petal.Width ~ Sepal.Length, data = ver)
abline(lmC)

### direct relationship
lmC <- lm(Petal.Width ~ Sepal.Length, data = ver)
summary(lmC)

Coefficients:
             Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
(Intercept)   0.08326    0.27592   0.302    0.764    
Sepal.Length  0.20936    0.04631   4.521 4.04e-05 ***

Residual standard error: 0.1673 on 48 degrees of freedom
Multiple R-squared:  0.2986,	Adjusted R-squared:  0.284 
F-statistic: 20.44 on 1 and 48 DF,  p-value: 4.035e-05

 

Se puede ver que existe un efecto de la longitud de los sépalos sobre la anchura de los pétalos. El modelo es regularcillo, ya que sólo explica el 28 % de la varianza (R2), aunque es claramente significativo (p = 0,000004).

Modelo 1: Y = 0.083 + 0.209 X

Modelo 2

Para comprobar que hay mediación necesitamos que los otros dos modelos también sean significativos.

### Mediator Petal.Width (A)
lmA <- lm(Petal.Length ~ Sepal.Length, data = ver)
summary(lmA)

### Plot
plot(Petal.Length ~ Sepal.Length, data = ver)
abline(lmA)

Coefficients:
             Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) 
(Intercept)  0.18512 0.51421 0.360 0.72 
Sepal.Length 0.68647 0.08631 7.954 2.59e-10 ***

Residual standard error: 0.3118 on 48 degrees of freedom
Multiple R-squared: 0.5686, Adjusted R-squared: 0.5596 
F-statistic: 63.26 on 1 and 48 DF, p-value: 2.586e-10

 

Modelo 2: M = 0.185 + 0.686 X

El modelo 2 es también muy claro (R2 = 0.5596 y p << 0.05).

Modelo 3

lmB <- lm(Petal.Width ~ Petal.Length, data = ver)
summary(lmB)

### Plot
plot(Petal.Width ~ Petal.Length, data = ver)
abline(lmB)

Coefficients:
              Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) 
(Intercept)   -0.08429 0.16070 -0.525 0.602 
Petal.Length   0.33105 0.03750  8.828 1.27e-11 ***

Residual standard error: 0.1234 on 48 degrees of freedom
Multiple R-squared: 0.6188, Adjusted R-squared: 0.6109 
F-statistic: 77.93 on 1 and 48 DF, p-value: 1.272e-11

 

Modelo 3: Y = -0.084 + 0.331 M

El modelo 3 es todavía mejor, explicando el 61 % de la varianza.

¿hay mediación o no?

Con los tres modelos anteriores ya sabemos que hay mediación ya que los tres modelos son significativos.

Lo que vamos a ver ahora es hasta donde llega esta mediación o el valor de C’ o el efecto de X sobre Y teniendo en cuenta que parte de dicho efecto pasa a través de M.

### Mediator Petal.Width (C2)
lmC2 <- lm(Petal.Width ~ Sepal.Length + Petal.Length, data = ver)
summary(lmC2)

Coefficients:
             Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
(Intercept)   0.01561    0.20446   0.076    0.939    
Sepal.Length -0.04149    0.05218  -0.795    0.430    
Petal.Length  0.36542    0.05731   6.376 7.25e-08 ***

Residual standard error: 0.1238 on 47 degrees of freedom
Multiple R-squared:  0.6239,	Adjusted R-squared:  0.6079 
F-statistic: 38.98 on 2 and 47 DF,  p-value: 1.046e-10

 

Se puede observar que:

  • La pendiente del efecto de la longitud de los sépalos sobre la anchura de los pétalos ha cambiado de
    • de C  = 0.209 , claramente significativa (p = 0,000004), en el modelo 1.
    • a   C’ = -0.041, no significativa (p = 0.43) en este modelo.

Es decir se ha perdido el efecto de la longitud de los sépalos y se puede decir que existe una mediación total por parte de la longitud de los pétalos. Todo el efecto de X sobre Y pasa a través de M.

O dicho de otra manera, el efecto de la longitud de los sépalos sobre la anchura de los pétalos se pierde al tener en cuenta el efecto de la longitud de los pétalos, lo que supone que la longitud de los pétalos afecta a la longitud de los pétalos y es la longitud de los pétalos la que afecta a la anchura de los mismos.

Sólo recuerda que aunque haya mediación estadística, eso no significa que haya mediación causal o que la causa real sea esa.

 

Tutorial búsqueda bibliográfica

En este tutorial voy a explicar cómo hacer una búsqueda exhaustiva de bibliografía sobre un tema concreto. Este debería ser siempre el primer paso al empezar cualquier trabajo nuevo. Para ello vamos a utilizar uno o varios buscadores (Polibuscador, Scopus, WoS) y un gestor de bibliografía (Zotero).

Polibuscador

enlace: https://polibuscador.upv.es

Polibuscador tiene la ventaja de permitir utilizarlo a cualquier persona desde cualquier sitio. Es igual para todos los usuarios incluso sin estar identificado. También se puede utilizar desde el móvil.

Identificarse.

En azul el link para identificarse.

Para que se guarden los resultados en favoritos. Entrar en el link e identificarse como miembro UPV. Doy por hecho que Raquel puede identificarse como alumna. Si ya estás en la intranet en otra pestaña, entra directamente.

Búsqueda avanzada.

Buscamos “palabra_1 palabra_2” AND “palabra_3” en “Advanced search” o “Búsqueda avanzada”. Las comillas sirven para buscar una expresión con dos o más palabras seguidas. Para una palabra da lo mismo ponerlas que no.

Se pueden buscar combinaciones de AND y OR, teniendo en cuenta que los AND se hacen antes que los OR, de forma parecida a cómo en una ecuación los * se hacen antes que las +. Se pueden utilizar paréntesis para cambiar esto.

 

Se pueden guardar las búsquedas que has hecho en el símbolo de la chincheta “Save query”.

Personalizar la búsqueda.

Tenemos 2232 resultados, interesa afinar un poco más.

Botón de personalizar la búsqueda.
Elegir el campo dentro del cual se quiere buscar.

Otros filtros

Se puede afinar un poco más la búsqueda antes de seleccionar artículos. En los filtros de la derecha, vamos revisando algunos ejemplos:

  • Expandimos los resultados más allá de las colecciones de la biblioteca. Para tener todos los resultados posibles.
En Tweak my results, seleccionar “Expand beyond library collections”.

 

 

 

  • Seleccionamos únicamente las revistas de impacto o al menos que sean revisadas por pares.

 

 

 

  • En Tipos de documentos seleccionamos únicamente artículos.

 

 

 

 

 

 

 

  • En “Recursos electrónicos” he seleccionado tres: Scopus, Science Citation Index y SpringerLink. Tengo mis dudas si no sería mejor utilizar sólo el Science Citation Index, que sería la forma de coger únicamente las revistas de impacto.
Electronic resources.

 

 

 

 

  • En “Lenguas” he seleccionado inglés y español. Aunque en español sólo hay 6 y para publicar igual sería mejor utilizar sólo el Inglés.
Languages.

 

 

 

 

  • No voy a tocar ni Autores, ni fechas, ni el resto de campos. Estoy pensando que la clasificación por fechas será mejor luego. Ahora quiero todos los artículos.
  • Tarda un buen rato, con los filtros puestos parece que tarda bastante. Paciencia.

Guardar resultados

Seleccionar con la chincheta los artículos que se quieren guardar.
  1. Lo primero es guardar la búsqueda, para si la queremos volver a hacer más tarde, o hacer modificaciones sobre la misma, que no haya que volver a empezar.
  2. Lo segundo es guardar las publicaciones en “Mis favoritas” o “My favorites”. Para ello hay que seleccionar pinchando en la chincheta de las que se quieran guardar.

Exportar

Exportar bibtex.

Desde “Mis favoritas”, marcar todas las publicaciones y exportarlas en formato ‘bibtex’, que se queda con la extensión ‘.bib’. Para ello pinchar en los … y luego la de más a la izquierda.

Se creará un archivo “Primo_BibTeX_Export.bib”.

 

Otros buscadores de bibliografía

Aparte de Polibuscador, podemos utilizar otros buscadores de bibliografía. Los más conocidos internacionalmente son:

Ambas funcionan bien desde la Universidad Politécnica de Valencia. La primera es mucho más restrictiva y es posible que no funcione desde otros sitios. La segunda creo que sí que funcionaría, aunque no lo he probado.

En ambas es posible hacer la búsqueda, seleccionar las publicaciones (permite seleccionar todas) y exportarlas en formato csv y/o bibtex. Importante marcar todos los campos que se quieran guardar, como el «abstract».

Las búsquedas se realizan de forma muy parecida a Polibuscador, por lo que no me detendré en ello.

Zotero

Lo siguiente que vamos a hacer es importar la biblioteca en Zotero, para luego exportarla en formato tabla, además de para ya tenerla ordenada en esta aplicación. Es muy útil para gestionar bibliografía.

Para instalar Zotero seguir el tutorial.

Importar la biblioteca bib (o csv) en Zotero

Seleccionar el archivo .bib que habíamos creado desde el Polibuscador.

 

 

Exportar la biblioteca desde Zotero

Desde Zotero podemos utilizar la biblioteca para citar artículos en nuestros trabajos o artículos. Hay plugins para Office, LibreOffice, e incluso Google Drive. Con éstos se puede citar los artículos en el texto e insertar una bibliografía al final. Para hacerlo en documentos Rmarkdown en R, también se puede, pero es necesario exportar la biblioteca previamente en el repositorio del proyecto.

Si queremos hacer un análisis bibliométrico, podemos exportar la biblioteca en formato CSV y abrirla en una tabla Excel para trabajar con ella como datos, más que como biblioteca. Para ello pincha con el botón derecho sobre la “colección o biblioteca” que queramos y hay una opción de “Exportar la colección”. Pinchar, seleccionar CSV y exportar.

En la tabla sale hasta los abstracts de los artículos, por lo que se pueden hacer búsquedas y ver cuantos tienen las palabras que queramos.

Recursos sobre Ecología de incendios (Actualizado 18-08-31)

El tema de los incendios forestales es uno de los temas candentes en nuestra sociedad. Debido a los cambios en el medio rural del último siglo se han recrudecido los incendios forestales. Aunque estamos lejos de llegar a consensos sobre cual es la mejor manera de gestionar nuestros montes y cómo reducir o paliar los efectos de los  incendios forestales y hay visiones claramente contrapuestas sobre el tema, hay algunos hechos que se pueden dar por ciertos.

  • Para que haya un incendio grave tiene que haber acumulación de material combustible y alguna fuente de ignición. El  tipo de material y las condiciones meteorológicas condicionan las temperaturas y la extensión del incendio.
  • Los incendios forestales forman  parte de la dinámica natural de los ecosistemas mediterráneos. No se pueden evitar totalmente, pero  se puede disminuir su frecuencia y hacer que el daño que produzcan cuando ocurren sea menor.
  • El recurso más importante a conservar en los montes mediterráneos es el suelo. Si se pierde el suelo, como ya se ha perdido en muchas zonas, el bosque no puede volver a recuperarse nunca (al menos no el mismo tipo de bosque que con suelo), ya que los suelos actuales no se  han creado con el clima actual sino en climas más fríos que ya no volveremos a tener.

En la gestión de los montes españoles se suele tener en cuenta el primer punto y casi nunca el segundo o el tercero, que son igual o más importantes.

Bibliografía sobre Incendios

Mapas:

Mapa de Incendios de la NASA

European Forest Fire Information System

Articulos:

Videos sobre incendios

Si conocéis más recursos gratuitos que merezcan la pena, podéis ponerlos en comentarios y los añadiré.

Materiales útiles para educación ambiental (Actualizado 2018-05)

En ocasiones me sorprende cuando descubro poca sensibilidad con los problemas ambientales en los medios o incluso en foros universitarios. En general los problemas ambientales «suenan conocidos» porque alguna vez fueron mal contados por los medios, pero no se conocen en realidad. Y eso que nos afectan a todos, o igual por eso mismo. Sin embargo no será por falta de información disponible en todos los formatos posibles. Aquí os dejo una recopilación de recursos que pueden ser útiles para la educación ambiental a diferentes niveles. No pretende ser completo, ya que los temas son muy amplios, y si me enviáis sugerencias preferiblemente de acceso libre, las añado. Lo separaré por formatos y temas y lo iré actualizando según vaya encontrando más cosas.

Informes y documentos

  • Ecowiki (actualmente sin mantenimiento)

Cambio climático

Límites al crecimiento

Transgénicos

Nucleares

Chemtrails

Caza

Documentales

Sostenibilidad

Cambio climático

Diversidad

Bombas nucleares

Transgenicos

Especies invasoras

De todo un poco, recopilaciones

Webs interesantes

Sostenibilidad

Consumo

Grupos Ecologistas

Casi todos ellos tienen materiales útiles y colaboran si se les pide con actividades de educación ambiental.

Pasar a la acción

La mejor manera de hacer algo suele ser colaborar con ONGs o participar en actividades con ellas en forma de voluntariado. Puede ser útil para ir pensando alguno de estos manuales:

 Materiales propietarios (no libres) o desordenados

Otros materiales que me han aconsejado pero no son gratuitos o no tienen enlace en Internet (o no lo he encontrado todavía). Algunos  pueden llegar a ser difíciles de conseguir. Están bastante desordenados, pero así tenéis la referencia.

Si buscáis algo no gratuito igual os sirve este enlace.

Libros

  • A green history of the world. Clive ponting. Libro muy revelador. Se pueden leer partes aquí y un resumen aquí.
  • Colapso. Jared M. Diamond. No tan bueno como el anterior, pero traducido al español.
  • Raíces económicas del deterioro ecológico y social. José Manuel Naredo. 2006. Siglo XXI.
  • Vivir bien con menos y otros libros de Jorge Riechmann.
  • Educación y ecología. Ecologistas en acción. Estudio sobre el currículo oculto antiecológico de los libros de texto.
  • La primavera silenciosa. Rachel Carson. Libro fundamental en el ecologismo.
  • No logo, y otros libros de Naomi Klein.
  • El ecologismo de los pobres. Joan Martinez Allier. Sobre el movimiento ecologista en el Sur.
  • Los Papalagi. Ed. Integral.
  • Vivir ligeramente sobre la tierra. Premios nobel alternativos. Integral.
  • Perspectiva feminista en torno a la economía: el caso de los cuidados. Amaia López Orozco
  • Ecología para vivir mejor. Pere Subirana. Ed Icaria.
  • Patas arriba: la escuela del mundo al revés. Eduardo Galeano. S. XXI. (Todos los de Galeano, desde Venas abiertas de América Latina, Memorias del Fuego, …)
  • La ciudad de los niños. Francesco Tonuchi.
  • Informe Lugano. Susan George
  • El crepúsculo de la era trágica del petróleo. Ramón Fernandez Durán.
  • Erase una vez un pueblo. Avelino Hernández. (La boina del contador de cuentos)
  • El camello de hojalata. Cuento para peques a partir de 4º.
  • Consumir menos, vivir mejor. Toni Lodeiro.
  • Del hacha al chip.
  • Un planeta de gordos y hambrientos.
  • Coltan. Vazquez Figueroa.
  • Senderos de Libertad. Javier Moro.
  • Era media noche en Bophal. Javier Moro y Dominique Lapierre.
  • Las montañas de Buda. Javier Moro.
  • El grito silenciado”, “Hijas de la arena”, “Palestina, la sinfonia de la Tierra”. Todos de Ana Tortajada. Realidades de distintos conflictos.
  • El hombre que plantaba árboles. Jean Giono.
  • Todavía vivo. Joaquín Araujo.
  • Un mundo que agoniza. Miguel Delibes. 1994. Ed. Plaza y Janes.

Películas y documentales varios

  • Before the flood (Antes que sea tarde) National Geographic 2016. De pago.
  • Los dioses deben estar locos, Jaime Uys, 1980. Una comedia sobre la intervención de la civilización en una pacífica comunidad tribal.
  • En el mundo a cada rato: “Binta y la gran idea”, Javier Fesser, 2007, uno de los cortos de la película, para reflexionar sobre la civilización occidental desde la visión de niña senegalesa.
  • El jardinero fiel. Fernando Meirelles, 2001. Critica a las farmacéuticas, ambientada en Kenia.
  • Diamantes de sangre. Edward Zwich, 2006. Relación comercio diamantes con guerra.
  • Brazil. Ferry William, 1985. Una crítica a la tecnología en clave de ciencia ficción.
  • Store wars. Parodia de animación sobre la rebelión de los productos biológicos. Muy divertido para todos los públicos. (Youtube)
  • Quiero ser tortilla. Eduardo Puertas e Irene Ibarra. Veterinarios sin fronteras. Corto de animación sobre los riesgos de los biocombustibles para la soberanía alimentaria.
  • Moolaadé, Ousmane Sembene, 2005. Sobre las estrategias de las mujeres para enfrentarse a la ablación.
  • The Meatrix. Youtube. Animación sobre granjas industriales.
  • Rapa Nui. Kevin Reynolds, 1993. Relación de la cultura nativa de la Isla de Pascua con el medio
  • Naturaleza muerta. Jia Zhang-Ke, 2006. Documental chino sobre la construcción de presa en las Tres Gargantas, y el deterioro social y ecológico provocado.
  • Poniente, Chus Gutierrez, 2002. Sobre la realidad social de los invernaderos en El Ejido.
  • Corazón de la tierra, Antonio Cuadri, 2007. Película romántica, 1ª lucha ambiental española, en las minas de Rio Tinto.
  • La corporación. Mark Achbar y Jennifer Abbott, 2003. Documental canadiense de tres horas que estudia el comportamiento patológico de las grandes empresas.
  • La isla de las flores, Jorge Furtado, 1989. Corto brasileño sobre la pobreza. Espectacular y realizado con humor negro.
  • La pesadilla de Darwin. Hubert Sauper, 2004. Los negocios de países del norte que devastan la vida en el sur, en este caso en el Lago Victoria y sus pobladores.
  • Voces contra la globalización, 6 capítulos de la serie “Otro mundo es posible TV2”.
  • Camino al andar. Imágenes + entrevistas. Española.
  • El pan nuestro de cada día. Hora y media sin voz. Sobre agricultura y ganadería en países desarrollados.
  • Cenizas del cielo. Lucha en Asturias con el tema de la térmica.
  • La Selva esmeralda. Sobre deforestación amazónica.
  • Los últimos días del Edén. Sobre deforestación amazonía y las farmacéuticas.
  • Baraka. Lenta pero abre mentes.
  • Chinatown. Tema nuclear.
  • El síndrome de China. Tema nuclear.
  • El coltan. Un corto de 7 minutos, que nos cuenta nuestra implicación con el problema del mineral y su relación directa con los móviles y ordenadores, y las grandes marcas.
  • El carro de combate. Setem.
  • Y tú que sabes. Para reflexionar. Para nivel avanzado.
  • Que comemos hoy. 35 min.
  • Las espigadoras. Agnes Varda.2000. Una mirada diferente a la recuperación de lo abandonado.
  • Nómadas del viento. Jactes Perrin. 2002. Para aficionados a la naturaleza en bruto. Sobre la migración de las aves. Fotografía y música espectacular.
  • Home.
  • Super size me. El efecto que tiene sobre la salud la comida rápida y la relación con las multinacionales de la alimentación.
  • Deuda ecológica. De Ekologistak Martxan.
  • Nosotros alimentamos el mundo. Edwin Wagenhofer.2008. Documental sobre la globalización de la producción de alimentos y su relación con las desigualdades en el mundo.
  • La siembra letal. Marcel Viñas. Sobre el efecto del uso de pesticidas
  • Hambre de soja. Marcel Viñas. Sobre las trágicas consecuencias del monocultivo de soja transgénica en Argentina.
  • Soberanía alimentaria y agronegocio en Uruguay. REDES y Amigos de la Tierra.
  • Dinero hecho en casa. Alejo Hoijman. 2005. Documental sobre la alternativa económica del trueque.
  • Gran superficie. Consume hasta morir (Ecologistas en acción). Documental sobre las grandes superficies y el modelo de producción y consumo.
  • Bowling for Columbine. Michael Moor. Violencia, negocio de las armas y política del miedo. (Tiene otra película interesante sobre la sanidad privada en EEUU: Siko o algo así).

Agradecimientos

A Josevi y Lurdes que me pasaron una lista con muchas referencias que me fue muy útil. De ahí nace la idea de hacer este post. Yo simplemente he ampliado la lista.

Si conoces más recursos (mejor gratuítos) escribe en comentarios y voy añadiendo. Y por supuesto, si quieres difundir la lista eres libre de hacerlo).

Referencias de gestión forestal y restauración (Actualizado 8 mayo 2018)

Recopilación de materiales gratuitos y útiles sobre gestión forestal y restauración de hábitats. Además de las otras recopilaciones de este blog útiles para la gestión forestal:

Se pueden recomendar las publicaciones sobre la situación de los bosques del mundo:

y en europa:

y la gestión de hábitats en España

  • Los libros de la colección «Manuals de gestió d’hàbitats» editada desde 2008 hasta 2015, que consta de once volúmenes sobre los principales hábitats que hay en Cataluña. Descarga gratuita en pdf.

Referencias sobre conectividad ecológica:

Restauración de Hábitats:

Inventarios de biodiversidad:

Libros y manuales del Ministerio:

Un libro muy interesante para profundizar en la  historia de los Espacios Protegidos de España.

Así como las recopilaciones de otras bibliotecas como:

 

Si conocéis más recursos gratuitos que merezcan la pena, o detectáis que algún  enlace ya no funciona, podéis ponerlos en comentarios y lo corregiré.

Referencias sobre fauna y su gestión (Actualizada)

Sobre la fauna española:

En el resto del mundo:

  • BirdLife International. 2017. European birds of conservation concern: populations, trends and national responsibilities. Cambridge, UK: BirdLife International. 171 pp. [PDF]

En la Comunidad Valenciana:

Fauna a escala global

Mamíferos:

Aves:

Reptiles:

Anfibios:

  • Beltran et al. 2016. Guía de Anfibios de los Parques Nacionales Españoles. Organismo Autónomo Parques Nacionales. Ministerio de Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente. Madrid. 102 pp. [PDF
  • Amphibian Species of the World 

Peces:

Y sobre Gestión Pesquera:

Simulación de modelos poblacionales:

Métodos de Censos:

Fauna paleontológica:

Medidas preventivas y correctoras:

Si conocéis más recursos gratuitos que merezcan la pena, podéis ponerlos en comentarios y los añadiré.

Referencias útiles para Ecología e impacto ambiental

Para una primera aproximación, lo más interesante es hacerse con alguno de los libros de ecología general o de Impacto ambiental, en concreto mi recomendación interesada serían obviamente mis libros:

Introducción práctica a la Ecología. Samo et al.
Evaluación de Impacto Ambiental, Garmendia et al.

Además de estos libros, es altamente aconsejable el programa Populus de la Universidad de Minesota, de simulación de modelos poblacionales, que utilizaremos en las prácticas de informática.

Otra publicación muy aconsejable es la Revista Ecosistemas, que tiene la ventaja de ser de las pocas sobre el tema en lengua española y con nivel. También puede ser interesante su blog.

La FAO tiene su propio libro de EIA para sus propios proyectos. Interesante como complemento.

 

Algunos libros interesantes relacionados con la asignatura son:

Visores webs interesantes para ver el mundo:

Guías de campo:

Otros recursos relacionados con la asignatura se pueden encontrar en entradas de este blog:

Si buscáis algo no gratuito igual os sirve este enlace.

Si conocéis más recursos útiles, podéis ponerlos en comentarios y los añadiré.

Referencias sobre botánica

A pesar de que mucha de la información es difícil de encontrar y por tanto de utilizar, sí que existen recursos gratuitos de fácil acceso que nos pueden ayudar a entender la botánica:

Geobotánica y vegetación

Muy aconsejables los apuntes de Francisco José Alcaraz Ariza, muy ordenados y actualizados (no sólo los temas de teoría sino toda la web):
http://www.um.es/docencia/geobotanica/teoria.html

Sobre la vegetación de España por zonas, una buena referencia clásica son los 18 volúmenes de Itinera Geobotánica:

https://floramontiberica.wordpress.com/itinera-geobotanica/

Sobre el estado actual de la situación de los mapas de vegetación:

Sainz et al 2010 La Cartografía sintética de los paisajes vegetales españoles: Una asignatura pendiente en Geobotánica. Ecología 23: 249-272.

Otra aproximación diferente son los Atlas de Idoneidad de especies leñosas de la Península Ibérica.  http://www.opengis.uab.cat/IdoneitatPI/index.html

Y para bajarse los mapas en shp:

Rivas-Martinez 1987 Mapas Series Vegetación: http://www.magrama.gob.es/es/biodiversidad/servicios/banco-datos-naturaleza/informacion-disponible/memoria_mapa_series_veg_descargas.aspx

En la Comunidad Valenciana:
Costa 1982. Pisos bioclimáticos y series de vegetación en el área valenciana. Cuadernos de geografía, ISSN 0210-086X, Nº 31, 1982 , 129-144

A escala europea:

Visor del European Forest Data Center y sus descargas.

Zona andina:

Atlas de los Andes  del Norte y del Centro (ha dejado de funcionar: http://condesan.org/portal/sites/default/files/publicaciones/archivos/atlas_andes.pdf)

Flora

Para búsquedas sobre flora, lo mejor es ir directamente a las fuentes:

y los enlaces incluídos en ellos, de los que destacaría:

y las Bases de datos de biodiversidad:

Pero si sólo os interesan los árboles, lo mejor es  una App para el móvil:

  • ArbolApp. Una App para el móvil con los árboles de la Península Ibérica, Baleares y Canárias (ArbolappCanarias) editada por el CSIC. También tiene versión web en los enlaces anteriores.

Otros

En la parte normativa es importante tener en cuenta las listas-patrón de especies y hábitats publicadas por el Ministerio, con el objetivo de unificar su nomenclatura.

Para buscar más documentos de botánica, recomiendo la web de Jose Luis Benito, que tiene recopilados todos los enlaces importantes:

Y ya puestos, os dejo los enlaces a algunos libros interesantes de conservación de flora:

Si buscáis algo no gratuito igual os sirve este enlace.

Si conocéis más recursos gratuitos que merezcan la pena, podéis ponerlos en comentarios y los añadiré.

Cómo pasar los datos de tu GPS a capas de GIS en shape utilizando Qgis

La mayor parte de la información cartográfica pública se publica en formato shp, por lo que suele ser la mejor forma de editar, pasar a limpio y almacenar nuestros datos de distribución espacial. Los datos que recogemos con el receptor GPS se guardan normalmente (o al menos se pueden exportar) en formato GPX. Los datos de cada punto se suelen meter en libreta y de ahí a una tabla (o directamente en una tablet), pero no suele ser cómodo hacerlo en el mismo aparato, por lo que luego hay que juntar los datos. Vamos a ver cómo juntarlos en formato shp para poder utilizar otras capas de información geográfica y en futuros posts veré la forma de pasar los datos shp a R para poder realizar análisis de distribución espacial.

Si lo único que se quiere es visualizar o modificar los puntos o tracks y volver a guardarlos en gpx o volver a meterlos en el gps, lo mejor sería no complicarse la vida y utilizar Qlandkartegt o su nueva versión Qmapshack.

En este caso vamos a complicarlo un poco más que eso. Partimos de la base de que tenemos un archivo gpx con puntos y tracks y una tabla con los datos de cada punto en .csv (se puede exportar a .csv desde ods, xls o cualquier otro formato). Vamos a juntar ambos con Qgis y guardarlo todo en formato shp, o incluso volver a guardarlo como gpx. Pero mejor, paso a paso.

Si tienes muchos archivos gpx y csv, igual es mejor automatizar el proceso y juntar todos los archivos en un único shp utilizando R.

Primer paso: Abrir gpx en Qgis

Se pueden abrir los archivos gpx en Qgis clicando Capa>Añadir capa>Añadir capa vectorial…

qgis1

Se selecciona el archivo y se abren dos capas, la de waypoints (puntos) y la de tracks (líneas). Obviamente si se quieren guardar el resto de datos también se puede, pero no suelen ser interesantes.

qgis2 qgis3 qgis4

Paso 2: Comprobar que está todo en su sitio

Para comprobar que está todo en su sitio la mejor opción es utilizar alguno de los plugins de mapas web aconsejados (QuickMapServices, OpenLayers) y abrir de fondo algún mapa (osm, gmaps) para ver si los puntos están colocados donde se supone que deben estar. Si no está donde debe lo más probable es que haya que ajustar la proyección.

qgis5

Paso 3: limpiar tabla de atributos

Antes de añadir nuevos datos y marcas en la tabla de atributos es interesante ver qué es lo que hay ahí dentro y quitar todo lo que no sea útil. De todas las variables que introduce el gps en la tabla de atributos,  en nuestro caso la única información  útil es el nombre de cada waypoint, ya que es lo que vamos a utilizar para identificarlos y unir los datos de la tabla csv. Para quitar el resto de variables de la tabla de atributos hay que darle primero a editar y luego a eliminar columnas.

Importante: hay que haber guardado previamente la capa para poder editarla. Para ello: botón derecho>guardar como

qgis6 qgis7

 

 

 

 

 

 

 

En otros casos puede interesar conservar «ele» elevaciones, o «time» el momento en que se realizó el waypoint.

Un detalle importante es fijarse en que el nombre de los waypoints en este caso empiezan en 005. Los  ceros a la izquierda cuentan en el nombre, por lo que tendremos que ponerlos igual en la tabla csv. Para ello es importante ver en formato de número y añadir números a la izquierda antes de exportarlo como csv.

Paso 4: añadir datos a los waypoints a partir de una tabla de datos csv

Lo más importante que tiene que tener la tabla es una de las variables igual a alguna de las variables de la tabla de atributos de la capa. En el ejemplo la variable ID del archivo .csv es el nombre del punto, escrito exactamente igual que la variable «nombre» de la tabla de atributos, ceros a la izquierda incluidos.

qgis8

Para añadir los datos utilizamos el plugin MMQgis, que ya describí anteriormente.

qgis9qgis10

Importante fijarse en cada dato que te pide el formulario:

  • elegir el archivo csv,
  • poner el nombre de la variable,
  • la capa vectorial
  • y el nombre de la misma variable en la capa, para que los datos se unan adecuadamente.
  • También es interesante poner un nombre de archivo shape con el nombre de la nueva capa (ejemplo.shp)
  • y de los datos que no se han unido por si acaso (si todo va bien debería quedar vacío).

 

qgis11qgis12qgis13qgis14

Y como siempre que se trabaja con GIS, que no se te olvide guardar, en dos fases:

  • Cada capa por separado (formato shp, botón derecho y guardar como) para guardar los cambios en las tablas y situación de los puntos.
  • Y el proyecto (formato qgs) para guardar las localizaciones de cada capa, el orden y los colores elegidos.

Paso 5, o cerrando el bucle: Volver a guardar de shp a gpx

En caso necesario podéis volver a guardar la capa que queráis como gpx para volver a introducirla en vuestro gps, pero con los nuevos datos. Para ello botón_derecho, guardar _como,  gpx.